GraphPad Prism 統(tǒng)計(jì)指南 | 如何報(bào)告統(tǒng)計(jì)結(jié)果

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本篇文章是GraphPad總結(jié)出的關(guān)于如何有理有據(jù)的呈現(xiàn)我們的數(shù)據(jù)和分析，當(dāng)然，其中必須報(bào)告實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的細(xì)節(jié)，包括盲法和隨機(jī)化。

01 總體

• 每份統(tǒng)計(jì)文件均應(yīng)完整地報(bào)告所有方法（包括用于處理和分析數(shù)據(jù)的方法），以便其他人可以準(zhǔn)確地重現(xiàn)這些工作。
• 每個(gè)圖表均應(yīng)清晰地呈現(xiàn)數(shù)據(jù)（不得夸大地強(qiáng)調(diào)結(jié)論）。
• 應(yīng)完整地報(bào)告所有結(jié)果，保證不存疑義。
  

02 分析前的分析

• 是否已決定正態(tài)化？刪除異常值？轉(zhuǎn)換成對數(shù)？平滑？移除基線？證明這些決定的合理性，并報(bào)告足夠的細(xì)節(jié)，以便任何人均可以開始使用你的數(shù)據(jù)并得到完全相同的結(jié)果。說明這些計(jì)算是預(yù)先計(jì)劃的還是在看到數(shù)據(jù)后才決定。
• 如果剔除異常值，請說明有多少異常值，用于識別異常值的標(biāo)準(zhǔn)是什么，以及這些標(biāo)準(zhǔn)是否作為實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的一部分預(yù)先選擇。
  

03 樣本量

• 報(bào)告你如何選擇的樣本量。
• 報(bào)告樣本量時(shí)，請確切解釋將什么計(jì)算在內(nèi)。當(dāng)n = 3時(shí)，3是指三種不同的動物、對一種動物的組織進(jìn)行三種不同的測定、對三種動物的組織進(jìn)行一種測定，還是在γ計(jì)數(shù)器中對一次實(shí)驗(yàn)分析批制備的制劑進(jìn)行三次重復(fù)計(jì)數(shù)...？
• 請事先說明你是在選擇樣本量，還是在看到結(jié)果累積后以特殊方式調(diào)整樣本量。
• 如果各組的樣本量不相等，則需要解釋原因。
  

04 避免P值篡改

• 對于每項(xiàng)分析（通常是每幅圖和每張表），請說明數(shù)據(jù)分析中的每一步是否遵循了預(yù)先計(jì)劃的方案。如果是在看到數(shù)據(jù)后才決定刪除異常值，則如是說。如果是在看到數(shù)據(jù)后才決定使用非參數(shù)檢驗(yàn)，則如是說。如果是在查看數(shù)據(jù)后才決定分析數(shù)據(jù)的對數(shù)，則如是說。
• 如果不能展示所做的每項(xiàng)分析，則至少對其進(jìn)行描述和列舉。
• 如果從一個(gè)樣本量開始，以另一個(gè)樣本量結(jié)束，需要準(zhǔn)確解釋你是如何決定添加額外樣本和/或剔除樣本。請說明這些決定是基于預(yù)設(shè)的方案，還是在實(shí)驗(yàn)過程中所做的。
  

05 繪圖數(shù)據(jù)

• 清晰呈現(xiàn)數(shù)據(jù)。著重于讓讀者看到數(shù)據(jù)，而不僅僅是結(jié)論。
• 如有可能，繪制單個(gè)數(shù)據(jù)的圖表，而非數(shù)據(jù)的匯總。如果散點(diǎn)圖中顯示的值過多，則考慮盒須圖或頻率分布。
• 如果選擇使用誤差條繪制平均值，則繪制可以顯示變異度的標(biāo)準(zhǔn)偏差誤差條，而非不能顯示變異度的平均值誤差條的標(biāo)準(zhǔn)誤差。
  

06 統(tǒng)計(jì)方法

• 說明檢驗(yàn)的全名。比如，不稱“t檢驗(yàn)”，而稱“配對t檢驗(yàn)”。
• 識別進(jìn)行計(jì)算的程序（包括詳細(xì)的版本號，GraphPad Prism可能是7.01或者9.0.1）。
• 說明所選擇的所有選項(xiàng)。重復(fù)測量？是否糾正不相等的方差？穩(wěn)健回歸？約束參數(shù)？分享參數(shù)？報(bào)告完整的詳細(xì)信息，以便任何人都可以開始使用你的數(shù)據(jù)，得到完全一樣的結(jié)果。
  

07 報(bào)告效應(yīng)量

• 大多數(shù)實(shí)驗(yàn)最重要的結(jié)果是效應(yīng)量。差值（或比率或增長百分比）有多大？或者兩個(gè)變量的相關(guān)性有多緊密？幾乎在所有情況下，你都可以用一個(gè)值來總結(jié)這種效應(yīng)量，并且應(yīng)該使用置信區(qū)間（通常是95%區(qū)間）來報(bào)告這種效應(yīng)。迄今為止，這是在論文及其摘要中報(bào)告的最重要的發(fā)現(xiàn)。
• 考慮以95%置信區(qū)間顯示效應(yīng)量（即差值或比率）的圖表。
  

08 報(bào)告P值

• 如有可能，請將P值報(bào)告為一個(gè)精確到有幾位數(shù)的數(shù)值，而非一個(gè)不等式。例如說“P值為0.0234”，而非“P＜0.05”。
• 如果存在任何可能的歧義，需要清楚說明P值檢驗(yàn)的零假設(shè)。如果不了解零假設(shè)，則不得報(bào)告一個(gè)P值（因?yàn)槊總�(gè)P值檢驗(yàn)一個(gè)零假設(shè)）！
• 比較兩組時(shí)，說明P值是單側(cè)還是雙側(cè)（與單尾或雙尾相同）。如果為單側(cè)，則說明你在收集數(shù)據(jù)之前預(yù)測的效應(yīng)方向（以及記錄的該預(yù)測）和記錄的該決定和預(yù)測。如果在收集數(shù)據(jù)之前并未做出該決定和預(yù)測，則不得報(bào)告一個(gè)單側(cè)P值。
  

09 報(bào)告統(tǒng)計(jì)假設(shè)檢驗(yàn)/顯著性

• 統(tǒng)計(jì)假設(shè)檢驗(yàn)用于根據(jù)單個(gè)P值做出確切的決策。一種用途是在兩種可選模型之間進(jìn)行選擇。如果P值小于預(yù)設(shè)閾值，則選擇一個(gè)模型，否則就選擇另一個(gè)模型。執(zhí)行此操作時(shí)，說明兩種模型、在兩者之間選擇的方法、預(yù)設(shè)的閾值P值以及所選擇的模型。此外，也許還報(bào)告兩個(gè)模型的擬合優(yōu)度。
• 比較各組時(shí)，不必始終根據(jù)結(jié)果做出決定。如果你做出果斷決定，報(bào)告閾值P值、計(jì)算的P值是大于還是小于閾值，以及做出相應(yīng)決定。如果你未做決定，則報(bào)告其置信區(qū)間的效應(yīng)，也許是一個(gè)P值。如果你未根據(jù)該P(yáng)值做決定，則P值是否小于閾值并不重要，而統(tǒng)計(jì)假設(shè)檢驗(yàn)的整個(gè)概念也并不真正有用。
• “顯著”該詞有兩個(gè)相關(guān)的含義，因此在科學(xué)上造成了許多混淆事件。以上兩個(gè)要點(diǎn)表明，統(tǒng)計(jì)假設(shè)檢驗(yàn)的結(jié)果可以不用“顯著”該詞來報(bào)告。如果你選擇在這種情況下使用“顯著”該詞，請務(wù)必在其前面加上“統(tǒng)計(jì)”，這樣便不會造成混淆。
• 在討論結(jié)果的臨床或生理影響時(shí)，切勿使用“顯著”一詞。而是使用諸如“大”、“實(shí)質(zhì)性”和“臨床相關(guān)”等詞。在這種情況下使用“顯著”只會導(dǎo)致出現(xiàn)混淆情況。
  

10 多重比較

• 必須謹(jǐn)慎處理多重比較，記錄所有步驟。請注意，多重比較的問題很普遍，這不僅僅是方差分析后進(jìn)行后續(xù)檢驗(yàn)時(shí)的問題。
• 說明是否計(jì)劃了所有比較并報(bào)告了所有計(jì)劃的比較。如果報(bào)告了計(jì)劃外的比較或遺漏了一些比較，則必須將結(jié)果識別為初步結(jié)果。
• 如果在多重比較中采用了任何糾正措施，請解釋細(xì)節(jié)。
• 如需報(bào)告多重調(diào)整后P值，則明確指出這些P值已作調(diào)整。
  

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