cDNA、 Protein、 promoter、 引物設(shè)計(jì)、 BLAST
序列比對等
最近看到很多戰(zhàn)友在論壇上詢問如何查詢 基因序列、 如何進(jìn)行引物設(shè)計(jì)、 如何使用
BLAST 進(jìn)行序列比對……, 這些問題在 NCBI 上都可以方便的找到答案。 現(xiàn)在我就結(jié)合我
自
己使用 NCBI 的一些經(jīng)歷(經(jīng)驗(yàn)) 跟大家交流一下 BCBI 的使用。 希望大家都能發(fā)表自己
的使
用心得, 讓我們共同進(jìn)步!
我分以下幾個(gè)部分說一下 NCBI 的使用:
Part one 如何查找基因序列、 mRNA、 Promoter
Part two 如何查找連續(xù)的 mRNA、 cDNA、 蛋白序列
Part three 運(yùn)用 STS 查找已經(jīng)公布的引物序列
Part four 如何運(yùn)用 BLAST 進(jìn)行序列比對、 檢驗(yàn)引物特異性
特別感謝本版版主, 將這個(gè)帖子置頂!
從發(fā)帖到現(xiàn)在, 很多戰(zhàn)友對該帖給與了 積極的關(guān)注, 在此向給我投票的(以及想給我
投票卻暫時(shí)不能投票的) 各位戰(zhàn)友表示真誠的感謝, 謝謝各位戰(zhàn)友!
請大家對以下我發(fā)表的內(nèi)容提出自己的意見。 關(guān)于 NCBI 其他方面的使用也請水平較高
的戰(zhàn)友給予補(bǔ)充
First of all, 還是讓我們從查找基因序列開始。
第一部分 利用 Map viewer 查找基因序列、 mRNA
序列、
啟動子(Promoter)
下面以人的 IL6(白細(xì)胞介素 6) 為例講述一下具體的操作步驟
1. 打開 Map viewer 頁面, 網(wǎng)址為: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mapview/index.html
在 search 的下拉菜單里選擇物種, for 后面填寫你的目的基因。 操作完畢如圖所示: